सीएमएसएस के डीजी और सीईओ भारत सरकार के संयुक्त सचिव के पद के बराबर सीपीए का पूर्णकालिक कर्मचारी हैं। डीजी और सीईओ सीएमएसएस के समग्र प्रबंधन के लिए जिम्मेदार हैं और इन कार्यों के लिए जिम्मेदार जनरल मैनेजर द्वारा सहायता प्रदान की जाती है; (ए) प्रोक्योर्मेंट, (बी) लॉजिस्टिक्स, (सी) क्वालिटी कंट्रोल, (डी) बायो-मेडिकल, (ई) फाइनेंस, (एफ) एडमिनिस्ट्रेशन प्रधान कार्यालय में कुल कर्मचारियों की संख्या 13 है जिसमें 13 प्रबंधक और 17 सपोर्ट स्टाफ शामिल हैं।
प्रत्येक गोदाम में केवल 03 कर्मचारी होंगे, दो फार्मासिस्ट और एक आईटी व्यक्ति, पैकर और लोडर आउटसोर्स होंगे।